Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNMA1Q12791 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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KCNMA1Q12791 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNMA1Q12791 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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