Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NIPAL4Q0D2K0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NIPAL4Q0D2K0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms