Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSRP1Q08945 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSRP1Q08945 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms