Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNEQ04844 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNEQ04844 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms