Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ATP7AQ04656 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
ATP7AQ04656 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATP7AQ04656 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms