Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ERCC6Q03468 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ERCC6Q03468 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ERCC6Q03468 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms