Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL6Q02878 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL6Q02878 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPL6Q02878 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms