Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB1Q01826 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms