Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCCQ00597 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms