Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUCB2P80303 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUCB2P80303 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms