Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCL7P80098 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCL7P80098 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCL7P80098 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCL7P80098 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCL7P80098 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCL7P80098 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms