Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GNB1P62873 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB1P62873 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB1P62873 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB1P62873 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNB1P62873 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNB1P62873 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNB1P62873 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNB1P62873 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms