Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NCS1P62166 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NCS1P62166 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCS1P62166 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCS1P62166 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCS1P62166 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NCS1P62166 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NCS1P62166 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCS1P62166 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCS1P62166 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCS1P62166 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCS1P62166 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCS1P62166 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms