Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VBP1P61758 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VBP1P61758 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VBP1P61758 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms