Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVPABLB-1P60509 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVPABLB-1P60509 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms