Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CABP4P57796 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CABP4P57796 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CABP4P57796 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CABP4P57796 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CABP4P57796 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CABP4P57796 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CABP4P57796 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CABP4P57796 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CABP4P57796 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CABP4P57796 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CABP4P57796 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CABP4P57796 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CABP4P57796 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CABP4P57796 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CABP4P57796 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CABP4P57796 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CABP4P57796 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms