Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSDMDP57764 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSDMDP57764 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms