Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ELLP55199 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ELLP55199 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ELLP55199 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ELLP55199 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ELLP55199 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ELLP55199 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ELLP55199 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELLP55199 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms