Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF138P52744 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms