Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK4P51957 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK4P51957 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK4P51957 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK4P51957 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEK4P51957 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK4P51957 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK4P51957 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK4P51957 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK4P51957 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK4P51957 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK4P51957 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK4P51957 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK4P51957 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms