Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPP1CCP36873 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPP1CCP36873 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms