Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT2P35908 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT2P35908 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT2P35908 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT2P35908 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT2P35908 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT2P35908 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT2P35908 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT2P35908 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT2P35908 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT2P35908 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT2P35908 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT2P35908 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms