Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYH11P35749 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYH11P35749 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYH11P35749 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYH11P35749 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MYH11P35749 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MYH11P35749 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms