Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT9P35527 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT9P35527 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT9P35527 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT9P35527 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT9P35527 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT9P35527 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms