Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN7P35236 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPN7P35236 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms