Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD1P33897 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD1P33897 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms