Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms