Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPP30301 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPP30301 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MIPP30301 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MIPP30301 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MIPP30301 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MIPP30301 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MIPP30301 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MIPP30301 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MIPP30301 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MIPP30301 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms