Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD6P30203 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD6P30203 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD6P30203 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD6P30203 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD6P30203 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD6P30203 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD6P30203 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD6P30203 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD6P30203 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD6P30203 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD6P30203 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD6P30203 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD6P30203 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms