Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA1P29973 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGA1P29973 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms