Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRB3P28472 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms