Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PEX2P28328 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX2P28328 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX2P28328 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX2P28328 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms