Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE4AP27815 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE4AP27815 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms