Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRBP23467 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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