Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCP20941 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCP20941 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PDCP20941 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCP20941 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCP20941 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCP20941 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCP20941 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCP20941 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCP20941 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms