Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL9A1P20849 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms