Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB4AP20338 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms