Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDE6GP18545 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PDE6GP18545 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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