Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPI1P17947 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPI1P17947 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPI1P17947 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPI1P17947 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms