Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFHP12036 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFHP12036 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFHP12036 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms