Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MS4A1P11836 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A1P11836 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms