Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOP1P11387 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOP1P11387 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOP1P11387 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TOP1P11387 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOP1P11387 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOP1P11387 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1P11387 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms