Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms