Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC6P09630 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXC6P09630 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms