Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTNP04004 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTNP04004 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTNP04004 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTNP04004 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VTNP04004 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTNP04004 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTNP04004 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTNP04004 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTNP04004 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTNP04004 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VTNP04004 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VTNP04004 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms