Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNKO75909 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CCNKO75909 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCNKO75909 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNKO75909 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms