Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSDE1O75534 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSDE1O75534 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms