Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG13O75143 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG13O75143 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG13O75143 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG13O75143 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG13O75143 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG13O75143 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG13O75143 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms