Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN2BO60939 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN2BO60939 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms