Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSCO60682 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MSCO60682 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSCO60682 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSCO60682 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSCO60682 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSCO60682 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSCO60682 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSCO60682 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSCO60682 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSCO60682 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MSCO60682 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms